RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.46■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.43■□□□□ 0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 TRIM15Q9C019 465 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 FSCBQ5H9T9 825 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SFR1Q86XK3 245 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SNX25Q9H3E2 840 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.43■□□□□ 0.06
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