RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 KAT2BQ92831 832 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LENG9Q96B70 501 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LY75O60449 1722 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 RPA1P27694 616 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 BIRC3Q13489 604 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 MAN2A1Q16706 1144 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 FBF1Q8TES7 1133 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 WHAMMQ8TF30 809 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 COPS5Q92905 334 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 GCNT4Q9P109 453 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC160A6NGH7 325 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 AKAP3O75969 853 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 SMARCA1P28370 1054 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC38Q502W7 563 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC63Q8NA47 563 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 NACC1Q96RE7 527 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 GJB1P08034 283 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CDC25CP30307 473 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCD1P33897 745 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 VAV2P52735 878 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 RASIP1Q5U651 963 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM58Q8NG06 486 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM20AQ96MK3 541 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CUEDC2Q9H467 287 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 THAP9Q9H5L6 903 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL33A6NCF5 533 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT5P13647 590 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ATP11AP98196 1134 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LY6KQ17RY6 165 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 BATF3Q9NR55 127 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CASZ1Q86V15 1759 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC189A1A4V9 331 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT13P13646 458 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC12A3P55017 1021 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TAF11Q15544 211 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 VCXQ9H320 206 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 RCCD1A6NED2 376 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CA8P35219 290 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ACOT2P49753 483 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 USP14P54578 494 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 PGM5Q15124 567 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF394Q53GI3 561 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 NLRP4Q96MN2 994 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 MRIQ9BWK5 157 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TRPC6Q9Y210 931 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 CUL3Q13618 768 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TUBB2AQ13885 445 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms