RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TSG101Q99816 390 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 RAB17Q9H0T7 212 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TLR2O60603 784 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NEBLO76041 1014 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 AGTP01019 485 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 OR52Z1P0C646 297 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MAP3K10Q02779 954 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SCLT1Q96NL6 688 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 CENPHQ9H3R5 247 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NYAP2Q9P242 653 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ESYT3A0FGR9 886 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM187AA6NFU0 413 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC169A6NNP5 214 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TBC1D12O60347 775 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 26.7
EFTUD2-201ENST00000402521 ASIC1P78348 528 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ECM1Q16610 540 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 DYMQ7RTS9 669 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 OPLAHO14841 1288 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SORBS3O60504 671 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SPP2Q13103 211 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 BLMHQ13867 455 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 PRR16Q569H4 304 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MFSD5Q6N075 450 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NSMCE1Q8WV22 266 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 RRAGCQ9HB90 399 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 POTEFA5A3E0 1075 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 A6NHS1 94 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MEIS1O00470 390 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MEIS2O14770 477 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 AHCYL1O43865 530 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FESP07332 822 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 CALCRLQ16602 461 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 POTEEQ6S8J3 1075 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SV2BQ7L1I2 683 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 KCNK18Q7Z418 384 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MKL1Q969V6 931 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 WRNIP1Q96S55 665 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ESYT2A0FGR8 921 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 hCG_1984214I3L0E3 225 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAF5O00463 557 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 BUB1O43683 1085 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MTMR2Q13614 643 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 PDIA5Q14554 519 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 C6orf118Q5T5N4 469 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 FBXO11Q86XK2 927 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM59Q8IWR1 403 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SAAL1Q96ER3 474 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 CALML4Q96GE6 196 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SAMD15Q9P1V8 674 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 ANP32DO95626 131 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 PDE6CP51160 858 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 STAT2P52630 851 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 RWDD2BP57060 319 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms