RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 FSD2A1L4K1 749 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF623O75123 536 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DDHD2O94830 711 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DEXIO95424 95 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CXCL14O95715 111 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ASGR2P07307 311 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PSMA5P28066 241 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 SLC11A1P49279 550 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 KRT17Q04695 432 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CASP10Q92851 521 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 NLRP4Q96MN2 994 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CHST12Q9NRB3 414 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DACT1Q9NYF0 836 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 MYO10Q9HD67 2058 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CTDNEP1O95476 244 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CTSAP10619 480 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 AVPR2P30518 371 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 SCRN1Q12765 414 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PPP2R5CQ13362 524 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN14Q15678 1187 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF410Q86VK4 478 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM143Q96AN5 459 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 IRAK3Q9Y616 596 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 F8W810 466 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 LILRB3O75022 631 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PSMC5P62195 406 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 LETM2Q2VYF4 491 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM169Q96HH4 297 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 GBP3Q9H0R5 595 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 RNF39Q9H2S5 420 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 RGL1Q9NZL6 768 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-202ENST00000393503 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 WNT7AO00755 349 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 REC8O95072 547 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 EFEMP2O95967 443 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN5P54829 565 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 ITIH3Q06033 890 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 POTEDQ86YR6 584 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 MARCH5Q9NX47 278 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 PLXNA3P51805 1871 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 CA8P35219 290 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 DNM2P50570 870 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 TNFRSF25Q93038 417 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 LXNQ9BS40 222 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-202ENST00000393503 CPLX1O14810 134 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms