RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM49CP0CI26 452 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 HSD17B3P37058 310 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 LPAR1Q92633 364 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 SPP2Q13103 211 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 PLS1Q14651 629 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS36Q86VN1 386 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 MYZAPP0CAP1 466 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 METTL13Q8N6R0 699 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 INTUQ9ULD6 942 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 H0YGN5 161 aa25.89■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 GFPT2O94808 682 aa25.89■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.89■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.89■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 NFS1Q9Y697 457 aa25.89■■□□□ 1.74
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 GGA2Q9UJY4 613 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 K7ENM7 598 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PEX26Q7Z412 305 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP14Q86W24 1093 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT8L2Q96SF2 557 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PIM2Q9P1W9 311 aa25.88■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 F8VZ95 297 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 EVI5O60447 810 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 H2AFZP0C0S5 128 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RARRES1P49788 294 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 NPEPPSP55786 919 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR1Q13613 665 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 H2AFVQ71UI9 128 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR88Q9GZN0 384 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TISP43B9A030 160 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 KRIT1O00522 736 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 FSBPO95073 299 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM107AO95990 144 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 FERP16591 822 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 VCAM1P19320 739 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 STAT1P42224 750 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 BIRC3Q13489 604 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR3Q13615 1198 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TNIP1Q15025 636 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R5AQ15172 486 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 CNPY4Q8N129 248 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RDH13Q8NBN7 331 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 JDP2Q8WYK2 163 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.87■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM150BA6NC51 233 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 EXOC3O60645 756 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 STK33Q9BYT3 514 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SOX5P35711 763 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 BFSP1Q12934 665 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR2Q13614 643 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PGM5Q15124 567 aa25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC24CP53992 1094 aa25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF844Q08AG5 666 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms