RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MAML3Q96JK9 1138 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 DKK2Q9UBU2 259 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 INSL6Q9Y581 213 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MTSS1O43312 755 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FOXI1Q12951 378 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 KCNA6P17658 529 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FNTBP49356 437 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SEC24CP53992 1094 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LCORLQ8N3X6 602 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 E2F7Q96AV8 911 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 PROB1E7EW31 1015 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 DAPK3O43293 454 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 NCR1O76036 304 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FAM153BP0C7A2 387 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 VPS72Q15906 364 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 METTL24Q5JXM2 366 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SCLYQ96I15 445 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 COQ10AQ96MF6 247 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 NDC1Q9BTX1 674 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 DVL2O14641 736 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 AVPR1BP47901 424 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM177Q53S58 311 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 PDPK1O15530 556 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G5P39877 138 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FOXF2Q12947 444 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 BRAPQ7Z569 592 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 BOCQ9BWV1 1114 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 MYADML2A6NDP7 307 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 MYBPC3Q14896 1274 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TTC38Q5R3I4 469 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 NELL1Q92832 810 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ING3Q9NXR8 418 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 LEFTY2O00292 366 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC6O75061 913 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFA10O95299 355 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 C1RP00736 705 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 RASGRF1Q13972 1273 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 MTERF2Q49AM1 385 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 CAVIN3Q969G5 261 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 GMLQ99445 158 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 SOX7Q9BT81 388 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 PIPSLA2A3N6 862 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 EFCAB14O75071 495 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 KRT37O76014 449 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 HKR1P10072 659 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 CXCR5P32302 372 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 KIF11P52732 1056 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ANKS1AQ92625 1134 aa6.37□□□□□ -1.39
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