RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FGD4Q96M96 766 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINI1Q99574 410 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RASA4BC9J798 803 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RASA4O43374 803 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY1Q01534 308 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 MAML1Q92585 1016 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SAAL1Q96ER3 474 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 MYBL1P10243 752 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FCER1AP12319 257 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RFFLQ8WZ73 363 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM49P0CI25 452 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM49CP0CI26 452 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS15P98073 1019 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF543Q08ER8 600 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 MMEP08473 750 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC31Q6UY01 552 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GPD1LQ8N335 351 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM24O75264 130 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TAC1P20366 129 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TTC17Q96AE7 1141 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 EMSYQ7Z589 1322 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CSF1RP07333 972 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 OCRLQ01968 901 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DMTNQ08495 405 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DCTN3O75935 186 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 EFNA5P52803 228 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 THEGQ9P2T0 379 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FAM187AA6NFU0 413 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 M0QYV0 167 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA4LO95757 839 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 IL1RL1Q01638 556 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 E2F5Q15329 346 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 DRC3Q9H069 523 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PDCLQ13371 301 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PDXDC1Q6P996 788 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA33Q96N06 139 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TIPINQ9BVW5 301 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD5Q96G74 571 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 BNIP3LO60238 219 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 BCAR1P56945 870 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SKIP12755 728 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 KIF2CQ99661 725 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms