RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363433.1

RNU6-940P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 940, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-940P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-940P-201ENST00000363433 DAAM2Q86T65 1068 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PLXDC1Q8IUK5 500 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 RTKN2Q8IZC4 609 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 GLMNQ92990 594 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZNF479Q96JC4 524 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 MMP19Q99542 508 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 EGFL8Q99944 293 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 IL23AQ9NPF7 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 RNF181Q9P0P0 153 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 A0A0B4J293 547 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PRR23AA6NEV1 266 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 NGFRP08138 427 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CYP2D6P10635 497 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ATP2B4P23634 1241 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 DPY19L1Q2PZI1 675 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 FAM214AQ32MH5 1076 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 C14orf177Q52M58 125 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ANKRD39Q53RE8 183 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TSTD2Q5T7W7 516 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TMEM164Q5U3C3 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TMEM200BQ69YZ2 307 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 OVOS1Q6IE37 1185 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZNF549Q6P9A3 640 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CLEC14AQ86T13 490 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SYT12Q8IV01 421 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 WWC1Q8IX03 1113 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SYNPOQ8N3V7 929 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ANKRD53Q8N9V6 530 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 RNF31Q96EP0 1072 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 MEIS3Q99687 375 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 HEPHQ9BQS7 1158 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SLC6A15Q9H2J7 730 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SMOC1Q9H4F8 434 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CNNM2Q9H8M5 875 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZNF408Q9H9D4 720 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CLEC1BQ9P126 229 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 FBXO10Q9UK96 956 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 BACE2Q9Y5Z0 518 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CKAP5Q14008 2032 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TMEM129A0AVI4 362 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 C2orf78A6NCI8 922 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ACOT7O00154 380 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SLC27A2O14975 620 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 EXTL3O43909 919 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 FGBP02675 491 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PLS3P13797 630 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PRF1P14222 555 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 CD247P20963 164 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SSFA2P28290 1259 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 BCL6P41182 706 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ARHGAP25P42331 645 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 DSCR10P59022 87 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 KRTAP12-4P60329 112 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 PPP2R5DQ14738 602 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 STILQ15468 1287 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SPINK14Q6IE38 97 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 OR52N2Q8NGI0 321 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ATG4CQ96DT6 458 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SELENONQ9NZV5 590 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 GMIPQ9P107 970 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SERGEFQ9UGK8 458 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TELO2Q9Y4R8 837 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 A0A0G2JNJ9 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 E5RJQ4 531 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ARNTLO00327 626 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 ACOT8O14734 319 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TUBB4AP04350 444 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 TMEM191BP0C7N4 346 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 GNAT2P19087 354 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 GAS1P54826 345 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 SOX10P56693 466 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-940P-201ENST00000363433 KRTAP10-10P60014 251 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms