RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 KRT39Q6A163 491 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TNIP3Q96KP6 325 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 E7EVH7 732 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ARHGAP6O43182 974 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 KRT81Q14533 505 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.68□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 FSD2A1L4K1 749 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 KIF11P52732 1056 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 KCNB1Q14721 858 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PTGISQ16647 500 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SHC4Q6S5L8 630 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 BBS5Q8N3I7 341 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM199Q8N511 208 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 COX16Q9P0S2 106 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SMIM22K7EJ46 135 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CYTH3O43739 400 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 IL18RAPO95256 599 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 FGRP09769 529 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MYO1FO00160 1098 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CLTAP09496 248 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 RSPH10BP0C881 870 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 BIRC2Q13490 618 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PKN1Q16512 942 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PEX26Q7Z412 305 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 RBSNQ9H1K0 784 aa11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 A8MXQ7 604 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 EVI5O60447 810 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CTAGE8P0CG41 777 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CASP1P29466 404 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 NAMPTP43490 491 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 A6NJR5 290 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PIK3CDO00329 1044 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 LGALS2P05162 132 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PPP1R7Q15435 360 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 DLK2Q6UY11 383 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 NPTXRO95502 500 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CYP3A4P08684 503 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF365Q70YC5 407 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 GPT2Q8TD30 523 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PORCNQ9H237 461 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 EHD2Q9NZN4 543 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 PRCPP42785 496 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CALCOCO2Q13137 446 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CLUL1Q15846 466 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF394Q53GI3 561 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 CCDC77Q9BR77 488 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 NRCAMQ92823 1304 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 MYZAPP0CAP1 466 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 ACOT2P49753 483 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 RAB27AP51159 221 aa11.65□□□□□ -0.54
SEC24C-201ENST00000339365 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms