RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 KRT13P13646 458 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GANQ9H2C0 597 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 MAPK13O15264 365 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ACTN1P12814 892 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SCP2P22307 547 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 FMO5P49326 533 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 KIF18AQ8NI77 898 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 KCNN1Q92952 543 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TRIM49P0CI25 452 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TRIM49CP0CI26 452 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TERF1P54274 439 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 MORN1Q5T089 497 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 C17orf99Q6UX52 265 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PPTC7Q8NI37 304 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 DEPTORQ8TB45 409 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GCNT4Q9P109 453 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TLR2O60603 784 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 VAMP7P51809 220 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ACVR2BQ13705 512 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TRPC6Q9Y210 931 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 HBP1O60381 514 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 UCHL3P15374 230 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 STRN3Q13033 797 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 DRP2Q13474 957 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CBWD6Q4V339 395 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 IER5Q5VY09 327 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 BICD1Q96G01 975 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CCDC42Q96M95 316 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 A0A0U1RQJ8 604 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 K7ERI5 159 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 DLG4P78352 724 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 MAP2K5Q13163 448 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 AFG1LQ8WV93 481 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TCP11Q8WWU5 503 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CCDC102AQ96A19 550 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SAAL1Q96ER3 474 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 LGALS2P05162 132 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SMPD1P17405 629 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GARTP22102 1010 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CAPSQ13938 189 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SIX2Q9NPC8 291 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 LIG4P49917 911 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 KRT83P78385 493 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 FBXL18Q96ME1 805 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms