RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 LAD1O00515 517 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TNFAIP3P21580 790 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 STMN2Q93045 179 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PIGSQ96S52 555 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CAPN9O14815 690 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SKIP12755 728 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DEUP1Q05D60 604 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ECM1Q16610 540 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 VSTM1Q6UX27 236 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RASA4BC9J798 803 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SMAPO00193 183 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RASA4O43374 803 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SPOPO43791 374 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 KRT36O76013 467 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ASRGL1Q7L266 308 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CYP4X1Q8N118 509 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CREB3O43889 395 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 BAG2O95816 211 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PON1P27169 355 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RASSF2P50749 326 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ZBTB16Q05516 673 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TTC27Q6P3X3 843 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 VPS52Q8N1B4 723 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 BTBD6Q96KE9 485 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC42Q9Y546 428 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 NFAT5O94916 1531 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GSTT1P30711 240 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CASP4P49662 377 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SLAIN2Q9P270 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CFAP69A5D8W1 941 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SFI1A8K8P3 1242 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GNA11P29992 359 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 OVGP1Q12889 678 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 UBE2SQ16763 222 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 HES6Q96HZ4 224 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 STOML1Q9UBI4 398 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GNAZP19086 355 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CFAP157Q5JU67 520 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 KRT15P19012 456 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FOXN2P32314 431 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PALB2Q86YC2 1186 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ALG6Q9Y672 507 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 POTEB3A0JP26 581 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC160A6NGH7 325 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 POTECB2RU33 542 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PFDN1O60925 122 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 NPTXRO95502 500 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CHKAP35790 457 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 POTEBQ6S5H4 581 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 NSMFQ6X4W1 530 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PRELID2Q8N945 189 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 NPHS2Q9NP85 383 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 STK17AQ9UEE5 414 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SPEF2Q9C093 1822 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MYH4Q9Y623 1939 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CES2O00748 559 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MAPK13O15264 365 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CASP5P51878 434 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CDR2Q01850 454 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PROM2Q8N271 834 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms