RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 GLG1Q92896 1179 aa22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 IFT74Q96LB3 600 aa22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CEP72Q9P209 647 aa22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDK17Q00537 523 aa22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 HVCN1Q96D96 273 aa22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ACTN1P12814 892 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MARK3P27448 753 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GRB14Q14449 540 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 TERF2Q15554 542 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PDXDC1Q6P996 788 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 DPP9Q86TI2 863 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CPA4Q9UI42 421 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PON1P27169 355 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CNGA1P29973 690 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADSSP30520 456 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GANQ9H2C0 597 aa22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARL2P36404 184 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GLRA2P23416 452 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 RFC5P40937 340 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP2R5AQ15172 486 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GBP6Q6ZN66 633 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 KATNBL1Q9H079 304 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 VTA1Q9NP79 307 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRIM49P0CI25 452 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRIM49CP0CI26 452 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAPK4P31152 587 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 BFSP1Q12934 665 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.1■■□□□ 1.13
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RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM167AQ96KS9 214 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 FMO5P49326 533 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP1Q07960 439 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 RGMBQ6NW40 437 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAML3Q96JK9 1138 aa22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLCB4Q15147 1175 aa22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 EMSYQ7Z589 1322 aa22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ABL1P00519 1130 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 KRT13P13646 458 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 DLG4P78352 724 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CBWD6Q4V339 395 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 GCNT4Q9P109 453 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATP8B1O43520 1251 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 UCHL3P15374 230 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 DRP2Q13474 957 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 LAMC2Q13753 1193 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.08■■□□□ 1.13
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