RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 NIM1KQ8IY84 436 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SPATA5Q8NB90 893 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.87□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 A0A0U1RQJ8 604 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ABLIM3O94929 683 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 WEE1P30291 646 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FNTAP49354 379 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CENPAP49450 140 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 DRP2Q13474 957 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 COG8Q96MW5 612 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SENP2Q9HC62 589 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PMM2O15305 246 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FOXP2O15409 715 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 KRT86O43790 486 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MT-ND3P03897 115 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MMP1P03956 469 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LIFRP42702 1097 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 APOA5Q6Q788 366 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 C7orf31Q8N865 590 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 USP38Q8NB14 1042 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TEKT4Q8WW24 435 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MMS19Q96T76 1030 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GRIN2DO15399 1336 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NID2Q14112 1375 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 A0A1W2PQC6 194 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.85□□□□□ -0.83
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MMP3-201ENST00000299855 H7C1W4 665 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PDPK1O15530 556 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SNX4O95219 450 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 BMP15O95972 392 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CAPNS1P04632 268 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 IFNAR1P17181 557 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GPTP24298 496 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 KRT9P35527 623 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GJA5P36382 358 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SCNN1DP51172 638 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NEDD9Q14511 834 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GNPTABQ3T906 1256 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TRIM63Q969Q1 353 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CITED4Q96RK1 184 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TTPALQ9BTX7 342 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AK5Q9Y6K8 562 aa9.85□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MYH7P12883 1935 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 A0A087WZG4 1122 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MASP2O00187 686 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 N4BP3O15049 544 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ZBTB43O43298 467 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TLR5O60602 858 aa9.84□□□□□ -0.83
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