RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KRT13P13646 458 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MORC4Q8TE76 937 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 IFT74Q96LB3 600 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 KRT86O43790 486 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 VAMP7P51809 220 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ASIC2Q16515 512 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GPR20Q99678 358 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 COPS5Q92905 334 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SAAL1Q96ER3 474 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CCNA1P78396 465 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MYL7Q01449 175 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 IQCEQ6IPM2 695 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE9A4FU28 777 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ADRB2P07550 413 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 KIF5AQ12840 1032 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM50Q86XT4 487 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 CARD6Q9BX69 1037 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 EMSYQ7Z589 1322 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PPP3CAQ08209 521 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SPRYD7Q5W111 196 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 AZI2Q9H6S1 392 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GLRA2P23416 452 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MARK3P27448 753 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ADORA2AP29274 412 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 JAM2P57087 298 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ARMCX2Q7L311 632 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA33Q96N06 139 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ARL2P36404 184 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GLG1Q92896 1179 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN18Q99952 460 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ASB14A6NK59 587 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK13O15264 365 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA1P43355 309 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GCLMP48507 274 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MYO6Q9UM54 1294 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 USP20Q9Y2K6 914 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MCM3APO60318 1980 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 RFC5P40937 340 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 PTK2Q05397 1052 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 LMO3Q8TAP4 145 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD7Q92527 254 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 BICD1Q96G01 975 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087X0T9 212 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 LRRN2O75325 713 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 LGR5O75473 907 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 FAM228BP0C875 321 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 DRP2Q13474 957 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CST9Q5W186 159 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 MNS1Q8NEH6 495 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 H0YCG3 227 aa24.76■■□□□ 1.55
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