RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT31Q15323 416 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM60Q495X7 471 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EVPLQ92817 2033 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS13Q9NVM9 706 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPME1Q9Y570 386 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RETREG2Q8NC44 543 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOD1Q9Y239 953 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPN2P17655 700 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CASP5P51878 434 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NR1I3Q14994 352 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMC6Q7Z403 805 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KSR1Q8IVT5 923 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VSTM4Q8IW00 320 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE4BO95155 1302 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VTNP04004 478 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYBP10242 640 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLE2Q04725 743 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERINC5Q86VE9 423 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BSNDQ8WZ55 320 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DRC1Q96MC2 740 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKT3Q9Y243 479 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCNT3O95395 438 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTP1P59025 263 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNX17Q15036 470 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ODR4Q5SWX8 454 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.36■■□□□ 1.17
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FIZ1Q96SL8 496 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLRA2P23416 452 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARL2P36404 184 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD4P01730 458 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMOD1P28289 359 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNM2P50570 870 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSDMDP57764 484 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IER5Q5VY09 327 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.173e-7■■□□□ 12.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 N4BP3O15049 544 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLS3P13797 630 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCP11Q8WWU5 503 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIFAP3Q92845 792 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP63Q96MT8 703 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP7D2Q96T17 732 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDXKO00764 312 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
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