RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 BARHL2Q9NY43 387 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PFDN1O60925 122 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MCM7P33993 719 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CCDC42Q96M95 316 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 GBP5Q96PP8 586 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PAX3P23760 479 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MMP13P45452 471 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-9P63128 1117 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 IL17AQ16552 155 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CARD9Q9H257 536 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LGR5O75473 907 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PDE6CP51160 858 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 USP46P62068 366 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CXCL9Q07325 125 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PARP6Q2NL67 630 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 UCMAQ8WVF2 138 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 HAPLN3Q96S86 360 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 VPS33BQ9H267 617 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 O00370 1275 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 COBLO75128 1261 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 YY1P25490 414 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MCL1Q07820 350 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CBX3Q13185 183 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LSAMPQ13449 338 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 H7C1D1 291 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LCA5LO95447 670 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC10P48553 1259 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SERPINB4P48594 390 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 TCP10Q12799 353 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 FERMT2Q96AC1 680 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC18Q9H819 358 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PNMA2Q9UL42 364 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PJA2O43164 708 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 BMP15O95972 392 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SHBGP04278 402 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 DNM2P50570 870 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CACNA2D1P54289 1103 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 FAM196BA6NMK8 535 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SUN1O94901 812 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CYP11B2P19099 503 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 NELFBQ8WX92 580 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ZNF333Q96JL9 665 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PIGSQ96S52 555 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA13PA6NCF6 341 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CASP1P29466 404 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GPR162Q16538 588 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MUM1Q2TAK8 710 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 STKLD1Q8NE28 680 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RMND1Q9NWS8 449 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RHBDL2Q9NX52 303 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CEP104O60308 925 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PHEXP78562 749 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CHADLQ6NUI6 762 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCDC80Q76M96 950 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 HOOK3Q86VS8 718 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms