RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 C17orf99Q6UX52 265 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GBP6Q6ZN66 633 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.76■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 MAPK13O15264 365 aa24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TLR2O60603 784 aa24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 NDUFA10O95299 355 aa24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.75■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TRIM49P0CI25 452 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TRIM49CP0CI26 452 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ACTN1P12814 892 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 KRT13P13646 458 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 FMO5P49326 533 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PPTC7Q8NI37 304 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ZNF592Q92610 1267 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SCP2P22307 547 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 MAP2K5Q13163 448 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 DRP2Q13474 957 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ACVR2BQ13705 512 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 DEPTORQ8TB45 409 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GCNT4Q9P109 453 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TRPC6Q9Y210 931 aa24.74■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TUBB4AP04350 444 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 AFG1LQ8WV93 481 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CCDC102AQ96A19 550 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 HBP1O60381 514 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 LGALS2P05162 132 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CBWD6Q4V339 395 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 A0A0U1RQJ8 604 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SMPD1P17405 629 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 VAMP7P51809 220 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 DLG4P78352 724 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CAPSQ13938 189 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 IER5Q5VY09 327 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 BICD1Q96G01 975 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SIX2Q9NPC8 291 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 UCHL3P15374 230 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SREBF2Q12772 1141 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 STRN3Q13033 797 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SAAL1Q96ER3 474 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SIP14410 1827 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 ADRB2P07550 413 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 GARTP22102 1010 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 TCP11Q8WWU5 503 aa24.71■■□□□ 1.55
RNF170-201ENST00000240159 K7ERI5 159 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF170-201ENST00000240159 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF170-201ENST00000240159 KIF18AQ8NI77 898 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF170-201ENST00000240159 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF170-201ENST00000240159 FBXL18Q96ME1 805 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF170-201ENST00000240159 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms