RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 ITGA4P13612 1032 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 VAMP7P51809 220 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 PLS1Q14651 629 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 TCEAL1Q15170 157 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.78■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 DLG4P78352 724 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 GTF2BQ00403 316 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 CETN1Q12798 172 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGAP44Q17R89 818 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 EPC2Q52LR7 807 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 LPAR1Q92633 364 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 AGPAT1Q99943 283 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 TIPINQ9BVW5 301 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CLDN11-201ENST00000064724 EMSYQ7Z589 1322 aa18.77■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 GNGT1P63211 74 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PPP3CAQ08209 521 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PALB2Q86YC2 1186 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC45Q96CN5 670 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 THAP2Q9H0W7 228 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 CARD9Q9H257 536 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ABCB4P21439 1286 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 AMACRQ9UHK6 382 aa18.76■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 TISP43B9A030 160 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SPP2Q13103 211 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 MTMR1Q13613 665 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 C4orf19Q8IY42 314 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PLAAQ9Y263 795 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 H0YGN5 161 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 FGGP02679 453 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 HSD17B3P37058 310 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2R5EQ16537 467 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 KCTD16Q68DU8 428 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 COG5Q9UP83 839 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 NFS1Q9Y697 457 aa18.75■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 WNT10BO00744 389 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 LRRN2O75325 713 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 CLUL1Q15846 466 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 IWS1Q96ST2 819 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SAMM50Q9Y512 469 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PTENP60484 403 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 SLC20A1Q8WUM9 679 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.74■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 PFASO15067 1338 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 TTI1O43156 1089 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 ALAS1P13196 640 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 GCLMP48507 274 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 NCKAP1LP55160 1127 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CLDN11-201ENST00000064724 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms