RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifi35Q9D8C4 286 aa12.8□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 ErmardE9Q048 622 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map2k1P31938 393 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frat1P70339 274 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grm1P97772 1199 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spink5Q148R4 1017 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3UK37 420 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lin9Q8C735 542 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam111aQ9D2L9 613 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 RarbP22605 482 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk4P30285 303 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Senp1P59110 640 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpcr1Q3TNW5 500 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shc3Q61120 474 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fscn1Q61553 493 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces5aQ6AW46 575 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 E2f7Q6S7F2 904 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 PodnQ7TQ62 611 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem206Q9D771 350 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syt5Q9R0N5 386 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gcom1E9PZ54 550 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb3aG3X9V8 387 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp408H7BX78 710 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Guca2bO09051 106 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 EpoP07321 192 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyzapQ3UIJ9 466 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dzip3Q7TPV2 1204 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kctd6Q8BNL5 237 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt13Q8BYH3 481 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pop1Q8K205 1045 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 AagabQ8R2R3 316 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3eQ9CZT4 710 aa12.79□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx25Q3ZT31 840 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c29Q64458 490 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp3a11Q64459 504 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Panx2Q6IMP4 677 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asic3Q6X1Y6 530 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr180Q8BPS4 441 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc13a4Q8BZ82 625 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 RragcQ99K70 398 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcb6Q9DC29 842 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ralgps2Q9ERD6 590 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r87E9PZX4 848 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou3f3P31361 497 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf3Q5HZG4 932 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlg4Q62108 724 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcaf3Q6QR59 914 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mindy1Q76LS9 468 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 LppQ8BFW7 613 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppme1Q8BVQ5 386 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spata4Q8K3V1 295 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc12a9Q99MR3 914 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim30aP15533 496 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 AdssP46664 456 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhl11Q8CE33 709 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Six6os1Q9CTN5 574 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Castor1Q9CWQ8 331 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grtp1Q9D3N8 359 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl1Q9Z120 268 aa12.78□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina1eQ00898 413 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mkrn3Q60764 544 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 C6.1alQ7M757 291 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctdp1Q7TSG2 960 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trib2Q8K4K3 343 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa12.77□□□□□ -0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 AfmO89020 608 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irs1P35569 1233 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gas8Q60779 478 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r203Q8R273 311 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Creb3l3Q91XE9 479 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam217aQ9D9W6 419 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-OaQ9QWV1 250 aa12.77□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprcP06800 1291 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gng11P61953 73 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim43cP86449 446 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tp53i13Q5F267 385 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp6nlQ80XC3 819 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asic2Q925H0 512 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D2Q3 444 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arih1Q9Z1K5 555 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc152E9PX14 254 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8909G3UXE9 396 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms