RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 STAM2O75886 525 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 SMTNP53814 917 aa20.16■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.16■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.13■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 RIPK3Q9Y572 518 aa20.13■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 SLC16A4O15374 487 aa20.11■□□□□ 0.81
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CLN8-211ENST00000636934 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-211ENST00000636934 KIF22Q14807 665 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-211ENST00000636934 USP37Q86T82 979 aa20.11■□□□□ 0.81
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