RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CASD1Q96PB1 797 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 AAASQ9NRG9 546 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LZTS1Q9Y250 596 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 DMDP11532 3685 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR182O15218 404 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP3A4P08684 503 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC14Q08ET2 396 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 THNSL1Q8IYQ7 743 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 AIFM3Q96NN9 605 aa27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.06■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN21Q16825 1174 aa27.04■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF862O60290 1169 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 METTL13Q8N6R0 699 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA32Q96LK8 384 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 AVPR2P30518 371 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 FOSBP53539 338 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 ECHDC2Q86YB7 292 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 NOSTRINQ8IVI9 506 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 GABBR1Q9UBS5 961 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 CIITAP33076 1130 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.98■■□□□ 1.91
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