RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RGL1Q9NZL6 768 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SQORQ9Y6N5 450 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KAT6AQ92794 2004 aa10.22□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP6R2O75170 966 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STBD1O95210 358 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 YEATS4O95619 227 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RSPH10BP0C881 870 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP2C18P33260 490 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 USP46P62068 366 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP4A11Q02928 519 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC39A14Q15043 492 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ODR4Q5SWX8 454 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANO5Q75V66 913 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 USP38Q8NB14 1042 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TCP11Q8WWU5 503 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CEP170P1Q96L14 293 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAP7D2Q96T17 732 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IL23AQ9NPF7 189 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLIC4Q9Y696 253 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LOC100996750A0A140TA64 210 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ASAP2O43150 1006 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TLL1O43897 1013 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DGAT1O75907 488 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C22orf31O95567 290 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ACTN1P12814 892 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ITGB8P26012 769 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TXLNAP40222 546 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBA7P41226 1012 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCL23P55773 120 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STK38Q15208 465 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTPAQ15257 358 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MTERF2Q49AM1 385 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XKR9Q5GH70 373 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HYIQ5T013 277 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 METTL13Q8N6R0 699 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PIEZO1Q92508 2521 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CALML4Q96GE6 196 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 USP28Q96RU2 1077 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DNM3Q9UQ16 869 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WDR81Q562E7 1941 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TNFRSF10AO00220 468 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPTLC2O15270 562 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EFCAB14O75071 495 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MED24O75448 989 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FGBP02675 491 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CXCL10P02778 98 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSF2RAP15509 400 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RARRES1P49788 294 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KRT85P78386 507 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IL17AQ16552 155 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYLIPQ8WY64 445 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 APBB2Q92870 758 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CEP89Q96ST8 783 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms