RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF165	P49910	485 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMTN	P53814	917 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKT3	Q9Y243	479 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7ENM7	598 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	VTN	P04004	478 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2C9	P11712	490 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNA1	Q09470	495 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPS	Q13938	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAMPT	P43490	491 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SESTD1	Q86VW0	696 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP4	Q96MN2	994 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP7D2	Q96T17	732 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.1	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXD13	P35453	343 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJA8	P48165	433 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STIM1	Q13586	685 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED15	Q96RN5	788 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMA7	O14818	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R37	O75864	691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STX17	P56962	302 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NELFB	Q8WX92	580 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAVIN2	O95810	425 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAK1	Q13153	545 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTGIS	Q16647	500 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBSN	Q9H1K0	784 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8	1e-5	■□□□□ 8.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF2B	Q00403	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASAP2	O43150	1006 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQCB1	Q15051	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT8B	Q93098	351 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WZ62	844 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARVCF	O00192	962 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms