RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEB2O15479 319 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ASAP2O43150 1006 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R37O75864 691 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NPTX2P47972 431 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TFDP1Q14186 410 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNN1Q92952 543 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FIZ1Q96SL8 496 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS13Q9NVM9 706 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 Q9Y3F1 56 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR81Q562E7 1941 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID2Q68CP9 1835 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC16A4O15374 487 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT13P13646 458 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXD10P28358 340 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PBX1P40424 430 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 EFNA5P52803 228 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP135Q66GS9 1140 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 USP6NLQ92738 828 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PANX2Q96RD6 677 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PCYT2Q99447 389 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KATNBL1Q9H079 304 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM150BA6NC51 233 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX33O43247 280 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SKILP12757 684 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP4AP20648 1035 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TMOD1P28289 359 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CPT1AP50416 773 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCB4Q15147 1175 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX20Q9UMR3 447 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 DENND3A2RUS2 1198 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK13O15264 365 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 STX10O60499 249 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC3O60645 756 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS2P05162 132 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2B6P20813 491 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNJ6P48051 423 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FIGNQ5HY92 759 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TGFB1I1O43294 461 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL2P36404 184 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMC4P43686 418 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CETN1Q12798 172 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AFG1LQ8WV93 481 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 COPS5Q92905 334 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 BICD1Q96G01 975 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 POLD4Q9HCU8 107 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM3APO60318 1980 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KPNA6O60684 536 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MARK3P27448 753 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXD13P35453 343 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SPC25Q9HBM1 224 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-212ENST00000591041 K7ERI5 159 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-212ENST00000591041 SMPD1P17405 629 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42EP1Q00587 391 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-212ENST00000591041 NEK11Q8NG66 645 aa24.76■■□□□ 1.55
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