RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587878.1

ATP9B-211, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), humanhuman

TSL 3

Gene ATP9B, Length 344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9B-211ENST00000587878 ELF2Q15723 593 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 OXR1Q8N573 874 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 WDR48Q8TAF3 677 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MISP3Q96FF7 219 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 APIPQ96GX9 242 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PEX11GQ96HA9 241 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TBATAQ96M53 351 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PTPN18Q99952 460 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 GREM2Q9H772 168 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.76□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ZBTB7AO95365 584 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ARIH2O95376 493 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PFKMP08237 780 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MYF5P13349 255 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 NRG3P56975 720 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TRIM14Q14142 442 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FGL2Q14314 439 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SKAP1Q86WV1 359 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 NME8Q8N427 588 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 NUP43Q8NFH3 380 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TSPEARQ8WU66 669 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 NRG4Q8WWG1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TP53INP1Q96A56 240 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FAM167AQ96KS9 214 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 VPS11Q9H270 941 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 RSAD1Q9HA92 442 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.75□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SLC26A4O43511 780 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TLR5O60602 858 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRLP01236 227 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FAHP16930 419 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 COL8A1P27658 744 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ARL4AP40617 200 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CYP4F8P98187 520 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MVKQ03426 396 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ADRM1Q16186 407 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 AOC3Q16853 763 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 BICRALQ6AI39 1079 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SHISA5Q8N114 240 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ARL8AQ96BM9 186 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CRB3Q9BUF7 120 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 APOL5Q9BWW9 433 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.74□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 ACOT7O00154 380 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRKCAP17252 672 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 AOAHP28039 575 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PPM1AP35813 382 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PIK3CBP42338 1070 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 TECP42680 631 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 MCAMP43121 646 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PRIM2P49643 509 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 DRC7Q8IY82 874 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 GAB3Q8WWW8 586 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 RGMAQ96B86 450 aa6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATP9B-211ENST00000587878 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms