RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ZNF623	O75123	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MEOX1	P50221	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ADCY7	P51828	1080 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	GGN	Q86UU5	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	UBR7	Q8N806	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CHD1	O14646	1710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RAD17	O75943	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PFKM	P08237	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	IL2	P60568	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	BROX	Q5VW32	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PRSS38	A1L453	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC26A4	O43511	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CDC14B	O60729	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	APOL3	O95236	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	EYA4	O95677	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	LSP1	P33241	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OCRL	Q01968	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZEB2	O60315	1214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FOXL1	Q12952	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	STRN3	Q13033	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PDCD1	Q15116	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	LPP	Q93052	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PLSCR1	O15162	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PCDH8	O95206	1070 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	INSRR	P14616	1297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SELENOP	P49908	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RIN1	Q13671	783 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DDB1	Q16531	1140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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