RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	APPBP2	Q92624	585 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	IL17RA	Q96F46	866 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	NEK1	Q96PY6	1258 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	TCF12	Q99081	682 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PNR3	127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	SPINT1	O43278	529 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	PI15	O43692	258 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CELA3A	P09093	270 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	AKR1B1	P15121	316 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CYP7A1	P22680	504 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	MSX1	P28360	303 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	NRIP1	P48552	1158 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	GYS2	P54840	703 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ARSH	Q5FYA8	562 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	FLCN	Q8NFG4	579 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	S1PR5	Q9H228	398 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TRIM25-208	ENST00000574234	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		6.09	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	LAMA5	O15230	3695 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAMTS20	P59510	1910 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	UPP2	O95045	317 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	DNAJB1	P25685	340 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	PML	P29590	882 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	GIPR	P48546	466 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNC3	Q14003	757 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	TKFC	Q3LXA3	575 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	CCNJL	Q8IV13	435 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	SEPT8	Q92599	483 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	APBB2	Q92870	758 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRC3	Q9BY71	257 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR108	Q9NPR9	543 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	NCDN	Q9UBB6	729 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	FEM1B	Q9UK73	627 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	PPT2	Q9UMR5	302 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	ITPR1	Q14643	2758 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	MYH6	P13533	1939 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234		F5H6K3	240 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC30A4	O14863	429 aa		6.07	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms