RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.26■■□□□ 1.31
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.21■■□□□ 1.31
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EMSYQ7Z589 1322 aa23.2■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DGAT1O75907 488 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTP1P59025 263 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPS2Q13227 327 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO40Q9UH90 709 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 L1RE1Q9UN81 338 aa23.2■■□□□ 1.3
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