RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 STYK1Q6J9G0 422 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MGARPQ8TDB4 240 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PBKQ96KB5 322 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CYP26A1O43174 497 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RAD51CO43502 376 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SOX10P56693 466 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 OSTNP61366 133 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 GNPTABQ3T906 1256 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RAB21Q9UL25 225 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 USP20Q9Y2K6 914 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ADCY1Q08828 1119 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ZNF394Q53GI3 561 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PIM2Q9P1W9 311 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ITGB4P16144 1822 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 GLI1P08151 1106 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CAP2P40123 477 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MFAP3P55082 362 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PASD1Q8IV76 773 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RAB17Q9H0T7 212 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MARK3P27448 753 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 NF2P35240 595 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 BFSP1Q12934 665 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 DCAF15Q66K64 600 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 WDR93Q6P2C0 686 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TTI1O43156 1089 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CDK17Q00537 523 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 KAZNQ674X7 775 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MKL1Q969V6 931 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SLC35C1Q96A29 364 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 WDR18Q9BV38 432 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 WDR64B1ANS9 1081 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MYH3P11055 1940 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 METTL13Q8N6R0 699 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 AKT1S1Q96B36 256 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TLR2O60603 784 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 JAG1P78504 1218 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 C2CD6Q53TS8 623 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ATG4CQ96DT6 458 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 RASSF10A6NK89 507 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 IFNB1P01574 187 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TMOD1P28289 359 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CXCL9Q07325 125 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 DENND2CQ68D51 928 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ZNF365Q70YC5 407 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ZBTB33Q86T24 672 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 MYH7P12883 1935 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 CD58P19256 250 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 IFNAR2P48551 515 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 TRPC3Q13507 836 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 Q4G0T1 1027 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-209ENST00000556170 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK9-209ENST00000556170 DR1Q01658 176 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK9-209ENST00000556170 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK9-209ENST00000556170 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.152e-7■■■□□ 15.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms