RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554811.5

XRCC3-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, human

TSL 2

Gene XRCC3, Length 3,668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC3-208	ENST00000554811	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GDF3	Q9NR23	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PDXK	O00764	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CALCOCO2	Q13137	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	BIRC3	Q13489	604 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	DGKZ	Q13574	1117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	IQCK	Q8N0W5	287 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CAVIN3	Q969G5	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ECE2	O60344	883 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LMNB1	P20700	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	KAZN	Q674X7	775 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CHADL	Q6NUI6	762 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ISCU	Q9H1K1	167 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		12.82	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811		A0A1B0GUL6	1792 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	BCR	P11274	1271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	NPEPPS	P55786	919 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PPP2R2A	P63151	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	TNIP1	Q15025	636 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	EPHA7	Q15375	998 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	QPCT	Q16769	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811		A0A1W2PRG0	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	MME	P08473	750 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GABPA	Q06546	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PADI6	Q6TGC4	694 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ALG6	Q9Y672	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	EYA4	O95677	639 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	HOXD13	P35453	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CUL1	Q13616	776 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811		F8VZ95	297 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	JAG1	P78504	1218 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	RFFL	Q8WZ73	363 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PSMD1	Q99460	953 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	DOCK2	Q92608	1830 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	GAK	O14976	1311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	C21orf2	O43822	256 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PDE6B	P35913	854 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	MXI1	P50539	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	AP3B2	Q13367	1082 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	PRKG1	Q13976	671 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LONRF1	Q17RB8	773 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.8	□□□□□ -0.36
XRCC3-208	ENST00000554811	DPH6	Q7L8W6	267 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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