RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PROM2Q8N271 834 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 FAM107BQ9H098 131 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 BARHL2Q9NY43 387 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MYOM1P52179 1685 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 NR2F2P24468 414 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PEX3P56589 373 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-9P63128 1117 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-24P63145 666 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CENPKQ9BS16 269 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 GAKO14976 1311 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF202O95125 648 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MMP1P03956 469 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ALDH2P05091 517 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF197O14709 1029 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 NCK2O43639 380 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CTSHP09668 335 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 OR1G1P47890 313 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 GNG11P61952 73 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 GJA10Q969M2 543 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF558Q96NG5 402 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PSMD3O43242 534 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CAND2O75155 1236 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 OOSP2Q86WS3 158 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 EYA4O95677 639 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CLTAP09496 248 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PDIA5Q14554 519 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CASC4Q6P4E1 433 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ASIC4Q96FT7 647 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RAB17Q9H0T7 212 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf34Q49A92 452 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 METTL7BQ6UX53 244 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF410Q86VK4 478 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RNF149Q8NC42 400 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CEP63Q96MT8 703 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP99D6REC4 459 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 ALDH1A2O94788 518 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PFKMP08237 780 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TTC13Q8NBP0 860 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 VPS39Q96JC1 886 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MED15Q96RN5 788 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 KIF2CQ99661 725 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 WNT10BO00744 389 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms