RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ADSSP30520 456 aa22.88■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM143Q96AN5 459 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 LCTP09848 1927 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF185O15231 689 aa22.87■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 IWS1Q96ST2 819 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 PSMB7Q99436 277 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.87■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 BFSP1Q12934 665 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 DNERQ8NFT8 737 aa22.87■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 TBX20Q9UMR3 447 aa22.87■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 UBE4BO95155 1302 aa22.87■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 PPP3CAQ08209 521 aa22.86■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 LCA5LO95447 670 aa22.86■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 NFIL3Q16649 462 aa22.86■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.86■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF302Q9NR11 478 aa22.85■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 SMTNP53814 917 aa22.84■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.84■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 KRT13P13646 458 aa22.83■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 CXCR5P32302 372 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 DNA2P51530 1060 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 SLC18A3Q16572 532 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM50Q86XT4 487 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 PORCNQ9H237 461 aa22.83■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
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