RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 THAP9Q9H5L6 903 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 K7ENM7 598 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTS4O75173 837 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINC1P01008 464 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 UBASH3AP57075 661 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPN21Q16825 1174 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 GNASQ5JWF2 1037 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 MYADML2A6NDP7 307 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC169A6NNP5 214 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNJ18B7U540 433 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 GLRA2P23416 452 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 RTP1P59025 263 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 GTF2BQ00403 316 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNJ12Q14500 433 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT31Q15323 416 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ABHD8Q96I13 439 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF20AO95235 890 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PDXKO00764 312 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 IGBP1P78318 339 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TSG101Q99816 390 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PPME1Q9Y570 386 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KPNA6O60684 536 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-209ENST00000532457 KBTBD13C9JR72 458 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CLIC2O15247 247 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 C22orf31O95567 290 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 NR1I3Q14994 352 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SPC24Q8NBT2 197 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1B0GTH6 734 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TISP43B9A030 160 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 DNM1LO00429 736 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TEX33O43247 280 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 KLRC1P26715 233 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SMTNP53814 917 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 F2P00734 622 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAM9Q13443 819 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 IFT74Q96LB3 600 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS16Q9H269 839 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TBX20Q9UMR3 447 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE4BO95155 1302 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 DENND3A2RUS2 1198 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MYL3P08590 195 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CDC25BP30305 580 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 HIC1Q14526 733 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNA10Q16322 511 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 IER5Q5VY09 327 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ACCSQ96QU6 501 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 EVPLQ92817 2033 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 HAS3O00219 553 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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