RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532353.1

TRAF3IP2-AS1-210, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TCTN1Q2MV58 587 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LONRF3Q496Y0 759 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RNF149Q8NC42 400 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NLRP7Q8WX94 980 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DRC1Q96MC2 740 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NLRP4Q96MN2 994 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GDF15Q99988 308 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 REEP2Q9BRK0 252 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TNMDQ9H2S6 317 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IL23AQ9NPF7 189 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 USP25Q9UHP3 1055 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GINS2Q9Y248 185 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SQORQ9Y6N5 450 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SFI1A8K8P3 1242 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ZNF202O95125 648 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ACRP10323 421 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ZNF131P52739 623 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PTENP60484 403 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 POU5F1BQ06416 359 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DYMQ7RTS9 669 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DDX12PQ92771 950 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PAGE5Q96GU1 130 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GBP4Q96PP9 640 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MAGEF1Q9HAY2 307 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PFKMP08237 780 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PLS3P13797 630 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LIG1P18858 919 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CD52P31358 61 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NAMPTP43490 491 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PEX3P56589 373 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBE2HP62256 183 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TFDP1Q14186 410 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM228AQ86W67 206 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 USP38Q8NB14 1042 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IFT74Q96LB3 600 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SCLT1Q96NL6 688 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PADI3Q9ULW8 664 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FRMD3A2A2Y4 597 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LRRIQ4A6NIV6 560 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NR1I2O75469 434 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RPS6KA5O75582 802 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM13AO94988 1023 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FGFR4P22455 802 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CASP1P29466 404 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 AFMP43652 599 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PHKA2P46019 1235 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NPTX2P47972 431 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 AMPD3Q01432 767 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PPP2R5AQ15172 486 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TMEM240Q5SV17 173 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ZNF365Q70YC5 407 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SEPT8Q92599 483 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRIM9Q9C026 710 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TMX1Q9H3N1 280 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FGBP02675 491 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 BMP8BP34820 402 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PAK2Q13177 524 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CUL4BQ13620 913 aa13.63□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MYCT1Q8N699 235 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms