RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC42EP1Q00587 391 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 TPH2Q8IWU9 490 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF169Q8NCN4 708 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 IL9P15248 144 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP2B1P20020 1258 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 TXKP42681 527 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 C8orf76Q96K31 380 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 CD320Q9NPF0 282 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 CLDND1Q9NY35 253 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC01565O15544 149 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 RFC5P40937 340 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 EMC2Q15006 297 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 XKR9Q5GH70 373 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PPME1Q9Y570 386 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A087WWV3 80 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FGF18O76093 207 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 MCM7P33993 719 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PBX3P40426 434 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 POTEMA6NI47 508 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LYPLA2O95372 231 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 IGFLR1Q9H665 355 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 CHST12Q9NRB3 414 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 DACT1Q9NYF0 836 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXA2O43364 376 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 TBX10O75333 385 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PHKA2P46019 1235 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 HELQQ8TDG4 1101 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 AAASQ9NRG9 546 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 EOMESO95936 686 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LAG3P18627 525 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVFC1P60507 584 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LONRF3Q496Y0 759 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FERMT3Q86UX7 667 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ABI1Q8IZP0 508 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC43Q8N309 656 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 LPPQ93052 612 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 NCK2O43639 380 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM15Q13444 863 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF174Q15697 407 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 CLUL1Q15846 466 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 RARRES1P49788 294 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE3AQ05086 875 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 NBR1Q14596 966 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF149Q8NC42 400 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 MTRQ99707 1265 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 FSCN2O14926 492 aa26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3-204ENST00000528201 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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