RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527265.1

CLNS1A-208, Transcript of chloride nucleotide-sensitive channel 1A, human

TSL 2

Gene CLNS1A, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLNS1A-208	ENST00000527265	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	FZD7	O75084	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLPI	P03973	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	GSN	P06396	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	VDR	P11473	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF20	P17024	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ECI1	P42126	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	TERF1	P54274	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SCAND1	P57086	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	AMPD2	Q01433	879 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ACAP2	Q15057	778 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	POLH	Q9Y253	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLNS1A-208	ENST00000527265	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265		A6NCN8	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265		M0R3H8	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	STXBP3	O00186	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ARVCF	O00192	962 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SCG5	P05408	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CKM	P06732	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CD3E	P07766	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	HSD3B1	P14060	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NAT1	P18440	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	HOXC12	P31275	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GPR3	P46089	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	RXRG	P48443	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM193A	P78312	1265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	POU4F1	Q01851	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	BROX	Q5VW32	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265		A0A1B0GVC2	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NCAM2	O15394	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TGM5	O43548	720 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CP	P00450	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SYP	P08247	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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