RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.7■□□□□ 0.9
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF131P52739 623 aa20.7■□□□□ 0.9
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PTPRK-218ENST00000525459 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.96e-7■□□□□ 10.4
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PTPRK-218ENST00000525459 RPS6KA5O75582 802 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 CSF2RAP15509 400 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRK-218ENST00000525459 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 CEP290O15078 2479 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRK-218ENST00000525459 MBD3O95983 291 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 GHRP10912 638 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 IDEP14735 1019 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 NPTX2P47972 431 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 MYCT1Q8N699 235 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 BSNDQ8WZ55 320 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT8Q92599 483 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 STAMQ92783 540 aa20.65■□□□□ 0.9
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