RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	EYA3	Q99504	573 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT11	Q9BT88	431 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB34	Q9BZG1	259 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SIX2	Q9NPC8	291 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PANK4	Q9NVE7	773 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NAGPA	Q9UK23	515 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	INTU	Q9ULD6	942 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NHS	Q6T4R5	1651 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L15	C9J2P7	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L10	C9JJH3	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L11	C9JVI0	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L18	D6R9N7	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L22	D6RA61	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L19	D6RCP7	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L20	D6RJB6	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC188	H7C350	402 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP104	O60308	925 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BAG3	O95817	575 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LDHC	P07864	332 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G4B	P0C869	781 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GHR	P10912	638 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PDHB	P11177	359 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ACTN1	P12814	892 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP11B2	P19099	503 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PON1	P27169	355 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP2K2	P36507	400 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FLT3	P36888	993 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MMP14	P50281	582 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MNAT1	P51948	309 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC12A3	P55017	1021 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RHBDL3	P58872	404 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP2R2A	P63151	447 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GABPA	Q06546	454 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L24	Q0WX57	530 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PTK7	Q13308	1070 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	XRCC4	Q13426	336 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC51A	Q86UW1	340 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM228A	Q86W67	206 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GPBP1	Q86WP2	473 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	METTL13	Q8N6R0	699 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HES6	Q96HZ4	224 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NYX	Q9GZU5	481 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SWAP70	Q9UH65	585 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	STX8	Q9UNK0	236 aa		5.41	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms