RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511754.5

TNPO1-208, Transcript of transportin 1, human

TSL 5

Gene TNPO1, Length 433 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO1-208	ENST00000511754	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	TRAF5	O00463	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	DVL2	O14641	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PEX11B	O96011	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	JMJD7	P0C870	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ACAP1	Q15027	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	EPHA7	Q15375	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MFAP3L	O75121	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF460	Q14592	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CEP72	Q9P209	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754		A0A087X1B8	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CBX4	O00257	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	TOX4	O94842	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	APOL3	O95236	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC9A1	P19634	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SCNN1G	P51170	649 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	NPEPPS	P55786	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PRRX2	Q99811	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	GAS7	O60861	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	RFPL3	O75679	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	FSBP	O95073	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ASMTL	O95671	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PTGS2	P35354	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CSRP2	Q16527	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754		Q6ZRM9	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	XDH	P47989	1333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	RAMP2	O60895	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	GNAT2	P19087	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	SDS	P20132	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	NEK4	P51957	841 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ADAM8	P78325	824 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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