RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511605.1

SPATA20-218, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 4

Gene SPATA20, Length 559 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-218ENST00000511605 RFXAPO00287 272 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 ERVK-21P61565 698 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 FAM189BP81408 668 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 POU5F1BQ06416 359 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 KRT79Q5XKE5 535 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 TMEM143Q96AN5 459 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 CHST12Q9NRB3 414 aa20.54■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 ARL2P36404 184 aa20.53■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.53■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 SLC26A4O43511 780 aa20.52■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 KSR1Q8IVT5 923 aa20.52■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.52■□□□□ 0.88
SPATA20-218ENST00000511605 DACT1Q9NYF0 836 aa20.52■□□□□ 0.88
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SPATA20-218ENST00000511605 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.51■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 PP2D1A8MPX8 630 aa20.49■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 PTENP60484 403 aa20.49■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.49■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 COG5Q9UP83 839 aa20.49■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 SKIP12755 728 aa20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 FGFR4P22455 802 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPATA20-218ENST00000511605 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.48■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 RB1P06400 928 aa20.47■□□□□ 0.87
SPATA20-218ENST00000511605 LINC00271P0C7V0 271 aa20.47■□□□□ 0.87
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