RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511209.5

GPBP1-205, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene GPBP1, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-205	ENST00000511209	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PLD2	O14939	933 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PFKFB2	O60825	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	EVC	P57679	992 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SCRN1	Q12765	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	STK3	Q13188	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NTRK3	Q16288	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	JAML	Q86YT9	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	JAK2	O60674	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MBD3	O95983	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ESR1	P03372	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TM4SF1	P30408	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	GFRA1	P56159	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ANTXR2	P58335	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	HAND2	P61296	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ALX1	Q15699	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZNF213	O14771	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MED26	O95402	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TPM2	P07951	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	VAV1	P15498	845 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PDC	P20941	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	BMP8B	P34820	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	GYG1	P46976	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PSME4	Q14997	1843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ARNTL	O00327	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PRC1	O43663	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	RFPL3	O75679	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	ZNF205	O95201	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MBD4	O95243	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SCG5	P05408	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	MCM5	P33992	734 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	RFC4	P35249	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	STAT3	P40763	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	KCNJ6	P48051	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	AMPD2	Q01433	879 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	NFIX	Q14938	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-205	ENST00000511209	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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