RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.74□□□□□ -1.49
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM189BP81408 668 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF366Q8N895 744 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC9A6Q92581 669 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKS1AQ92625 1134 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DYDC2Q96IM9 177 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.66□□□□□ -1.5
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