RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	C11orf74	Q86VG3	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MATN3	O15232	486 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CPE	P16870	476 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	TNFRSF1A	P19438	455 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	COMT	P21964	271 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	FOXL1	Q12952	345 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	TCIRG1	Q13488	830 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RIN1	Q13671	783 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	DHCR24	Q15392	516 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	BROX	Q5VW32	411 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PRSS38	A1L453	326 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PFKM	P08237	780 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MASP1	P48740	699 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	BPIFB4	P59827	614 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	STRN3	Q13033	797 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	DDB1	Q16531	1140 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	USP7	Q93009	1102 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MYPN	Q86TC9	1320 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MUSK	O15146	869 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	KDM1A	O60341	852 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	LSP1	P33241	339 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CBWD5-231	ENST00000495615	MAFG	O15525	162 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	TOX4	O94842	621 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	CNGA1	P29973	690 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	GRM7	Q14831	915 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PDCD1	Q15116	288 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	EDA	Q92838	391 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	LPP	Q93052	612 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	ANO3	Q9BYT9	981 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	GAREM2	Q75VX8	874 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC1	Q99614	292 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	USP18	Q9UMW8	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1W2PRX2	142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CBWD5-231	ENST00000495615	PLSCR1	O15162	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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