RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494973.1

APTX-231, Transcript of aprataxin, human

TSL 4

Gene APTX, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-231	ENST00000494973	PEX3	P56589	373 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PTK7	Q13308	1070 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PTGIS	Q16647	500 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SERINC5	Q86VE9	423 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TMEM206	Q9H813	350 aa		14.94	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	BICDL2	A1A5D9	508 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CCDC169	A6NNP5	214 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	BIN1	O00499	593 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TREH	O43280	583 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GCNT3	O95395	438 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GLRA2	P23416	452 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	NPTX2	P47972	431 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CLCN3	P51790	818 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	STRN3	Q13033	797 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SCLT1	Q96NL6	688 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TSPY26P	Q9H489	355 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		14.93	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	COL6A1	P12109	1028 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CAGE1	Q8TC20	777 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TOX2	Q96NM4	488 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	EVPL	Q92817	2033 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GRIN2D	O15399	1336 aa		14.92	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SFI1	A8K8P3	1242 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CDK7	P50613	346 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GTF2B	Q00403	316 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	STK4	Q13043	487 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PAK1	Q13153	545 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	BFSP2	Q13515	415 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CAPS	Q13938	189 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SNX17	Q15036	470 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	MAPK6	Q16659	721 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ADSSL1	Q8N142	457 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	RNF149	Q8NC42	400 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	NLRP7	Q8WX94	980 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	NLRP4	Q96MN2	994 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ACCS	Q96QU6	501 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TSG101	Q99816	390 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	DENND3	A2RUS2	1198 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973		K7ERI5	159 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SLC16A4	O15374	487 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PPP1R37	O75864	691 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	GPC3	P51654	580 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	PTEN	P60484	403 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	TPM4	P67936	248 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	LRRC63	Q05C16	580 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	RBL2	Q08999	1139 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
APTX-231	ENST00000494973	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		14.9	□□□□□ -0.02

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