RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PLP2Q04941 152 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TCEA2Q15560 299 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 FIGNQ5HY92 759 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 BRAPQ7Z569 592 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 LGI4Q8N135 537 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 BDH2Q9BUT1 245 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 INVSQ9Y283 1065 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PCNTO95613 3336 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CPDO75976 1380 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF1BO60333 1816 aa4.37□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 USP32Q8NFA0 1604 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 EXOC5O00471 708 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNK3O14649 394 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CDC45O75419 566 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ASMTLO95671 621 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KNG1P01042 644 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 STPG3Q8N7X2 389 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD6Q96DN6 1003 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SMURF1Q9HCE7 757 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 FANCLQ9NW38 375 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TONSLQ96HA7 1378 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 USP6P35125 1406 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 LAMC1P11047 1609 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PPLO60437 1756 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 B4GALT3O60512 393 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL18O94889 574 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NPTXRO95502 500 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 IL18BPO95998 194 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NFATC3Q12968 1075 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT11Q96G61 164 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SPON1Q9HCB6 807 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KCND1Q9NSA2 647 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 STK32BQ9NY57 414 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CRB1P82279 1406 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF1AQ12756 1690 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ENPP3O14638 875 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PLATP00750 562 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGB3P05106 788 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 AMPHP49418 695 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 HERVK_113P62684 666 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC23AQ15436 765 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TXNRD1Q16881 649 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 Q6ZUG5 572 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PCGF6Q9BYE7 350 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms