RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489994.5

IFRD1-215, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IFRD1, Length 1,721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-215ENST00000489994 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.06□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.06□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TTC34A8MYJ7 566 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 M0R082 166 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CSPG5O95196 566 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 S100A6P06703 90 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TNFAIP3P21580 790 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MCM3P25205 808 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 STT3AP46977 705 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SOX9P48436 509 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 POLD2P49005 469 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 GSK3AP49840 483 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CHMP4BP1P59074 171 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CUL4BQ13620 913 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RAB33AQ14088 237 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 METTL24Q5JXM2 366 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 XP32Q5T750 250 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SV2BQ7L1I2 683 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DDX11Q96FC9 970 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ZFATQ9P243 1243 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MYO6Q9UM54 1294 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 NDUFAB1O14561 156 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TOR1BO14657 336 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 FBXO24O75426 580 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SLC4A1P02730 911 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 IVLP07476 585 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 IDO1P14902 403 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 HSD17B2P37059 387 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 HALP42357 657 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 EPS15P42566 896 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RAC1P63000 192 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 PLIN5Q00G26 463 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RAPH1Q70E73 1250 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TMC6Q7Z403 805 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 IP6K1Q92551 441 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TTPALQ9BTX7 342 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SNTG2Q9NY99 539 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MCM8Q9UJA3 840 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.05□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MCF2LO15068 1137 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 KLF4O43474 513 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 AHCYL1O43865 530 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 TOMM70O94826 608 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 YEATS4O95619 227 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 PSAPP07602 524 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 SLC5A1P13866 664 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 PRLRP16471 622 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MTHFRP42898 656 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 GJA9P57773 515 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DR1Q01658 176 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 GUCY1B3Q02153 619 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 DPYSQ14117 519 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MORC3Q14149 939 aa6.04□□□□□ -1.44
IFRD1-215ENST00000489994 MAP7Q14244 749 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms