RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	MEIS1	O00470	390 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DAPK3	O43293	454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTA2	O94776	668 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	FGG	P02679	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	KRT13	P13646	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF536	O15090	1300 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PLA2G6	O60733	806 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PSMD10	O75832	226 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	NDUFB10	O96000	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CASP4	P49662	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYL7	Q01449	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLITRK3	O94933	977 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	GHR	P10912	638 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	GZMA	P12544	262 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RIT2	Q99578	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP21	Q9UK80	565 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	TTI1	O43156	1089 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PHF2	O75151	1096 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	PDE6B	P35913	854 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	BFSP1	Q12934	665 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MAPK7	Q13164	816 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRADD	Q15628	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	CLIC2	O15247	247 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SCNN1D	P51172	638 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	NFIA	Q12857	509 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM39B-208	ENST00000487305	RAD21	O60216	631 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	GAS7	O60861	476 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	AGT	P01019	485 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	ITGA4	P13612	1032 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	STAT2	P52630	851 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	PMS2	P54278	862 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPC5	P78333	572 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.4	□□□□□ -0.27

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