RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
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RABGEF1-207ENST00000484547 CYP3A4P08684 503 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 FGFR4P22455 802 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNA4P22459 653 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
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RABGEF1-207ENST00000484547 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 LPPQ93052 612 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 ESYT2A0FGR8 921 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGEF1-207ENST00000484547 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.22□□□□□ -0.29
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