RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ESR2Q92731 530 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 KAT14Q9H8E8 782 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FRYQ5TBA9 3013 aa9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 DENND3A2RUS2 1198 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ANHXE9PGG2 379 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGAP6O43182 974 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TPM2P07951 284 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PLA2G2AP14555 144 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SDSP20132 328 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 GPC5P78333 572 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TROAPQ12815 778 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PGM5Q15124 567 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CEP68Q76N32 757 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 DGKHQ86XP1 1220 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 HOMER1Q86YM7 354 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 KAT6AQ92794 2004 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 RILPL2Q969X0 211 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM169Q96HH4 297 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TTC14Q96N46 770 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MAP7D2Q96T17 732 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 RGS18Q9NS28 235 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CLUHO75153 1309 aa9.01□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 NAV2Q8IVL1 2488 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 H0Y626 953 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 J3QKU1 62 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM16O95361 564 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CTSAP10619 480 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PCP11498 1178 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 KLRC2P26717 231 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MTAPQ13126 283 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 NEDD9Q14511 834 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SEC23AQ15436 765 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 LONP2Q86WA8 852 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 VPS52Q8N1B4 723 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC43Q8N309 656 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PHKBQ93100 1093 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MTMR8Q96EF0 704 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PIGSQ96S52 555 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MKNK1Q9BUB5 465 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PDCL3Q9H2J4 239 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MAD2L2Q9UI95 211 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TUBE1Q9UJT0 475 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF213O14771 459 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 AXIN1O15169 862 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 HRO43593 1189 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CYTH3O43739 400 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 TDGF1P13385 188 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 CXCL12P48061 93 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SP4Q02446 784 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 HTR4Q13639 388 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 MTSS1LQ765P7 747 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 NME8Q8N427 588 aa8.99□□□□□ -0.97
SZRD1-208ENST00000476423 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms