RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SYKP43405 635 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GPNMBQ14956 572 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 NLRP7Q8WX94 980 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 IFT74Q96LB3 600 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GUCD1Q96NT3 240 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SLFN14P0C7P3 912 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GLRA2P23416 452 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 NDUFA8P51970 172 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 LPIN1Q14693 890 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SHHQ15465 462 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 APBB2Q92870 758 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SCLT1Q96NL6 688 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GINS2Q9Y248 185 aa21.78■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 A0A087WZ62 844 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 GPR182O15218 404 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 HIP1RO75146 1068 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 RPS6KA5O75582 802 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 PTENP60484 403 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 KSR1Q8IVT5 923 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 DAW1Q8N136 415 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 RNF149Q8NC42 400 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 SEPT8Q92599 483 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 NLRP4Q96MN2 994 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 OSMRQ99650 979 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-207ENST00000472800 FGBP02675 491 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 GHRP10912 638 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ACTN1P12814 892 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 NAMPTP43490 491 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PHKA2P46019 1235 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 MAPK7Q13164 816 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 GIT2Q14161 759 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 DDX12PQ92771 950 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 VWCEQ96DN2 955 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 MYMKA6NI61 221 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 EFCAB14O75071 495 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ZNF202O95125 648 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PLS3P13797 630 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 SCP2P22307 547 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 UBE2HP62256 183 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 CAPSQ13938 189 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 KANK3Q6NY19 840 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 REEP2Q9BRK0 252 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PADI3Q9ULW8 664 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 LTBP2Q14767 1821 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 MYL1P05976 194 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ZNF131P52739 623 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 SMTNP53814 917 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PAK2Q13177 524 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 IKBKEQ14164 716 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 LONRF3Q496Y0 759 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 TMEM240Q5SV17 173 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 PARVGQ9HBI0 331 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-207ENST00000472800 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms